achtergrond Deleties van chromosoom 22q11 (velocardiofaciaal syndroom; vcfs) hangen samen met dysmorfieën en een hoge prevalentie van schizofrenie. Met genexpressieprofilering is het mogelijk veranderingen in biologische netwerken te onderzoeken. In schizofrenie is de genexpressie van witte bloedcellen onderzocht. Wij onderzochten de genexpressie van witte bloedcellen bij patiënten met vcfs.

doel Meten van de expressie van 22q11- genen en onderzoeken of 22q11-genen tezamen met genen buiten deze regio deelnemen in signaalketens relevant voor vcfs en schizofrenie.

methode rna van witte bloedcellen van patiënten en controlepersonen (beiden n = 7) werd geïsoleerd. De genexpressie werd gemeten met de Affymetrix U133 plus 2.0-microarray. Wij pasten twee statistische criteria toe die twee verzamelingen genen opleveren (V1 en V2) die verschillend tot expressie komen tussen patiënten- en controlegroep. V1 werd gevonden door 'locally adaptive statistical procedure' (lap); deze methode combineert t-toets met chromosomale locatie. V2 werd gevonden door genen te selecteren waarvoor bij de t-toets gold dat p < 0,05 en waarbij de ratioverandering > 1,5 was. V1 en V2 werden geanalyseerd met de Ingenuity Pathway Knowledge Base (ipkb). ipkb bevat informatie over genetische netwerken en biologische signaalketens.

resultaten Met lap identificeerden wij 29 genen (V1) die verschillend tot expressie komen, alle gelegen op 22q11. V2 bestaat uit 286 genen grotendeels gelegen buiten 22q11. Met ipkb identificeerden wij 11 signaalsystemen die verschilden bij patiënten en controlepersonen, namelijk die voor natural killer(nk)-cel , neurotrofine/ trk, fibroblastgroeifactor (fgf), leukocytextravasatie, neureguline, complement- en coagulatiecascades, platelet-derived groeifactor (pdgf), extracellulair signal-regulated kinase (erk)/mitogen activated proteïnekinase (mapk), axonal guidance, ziekte van Huntington en actinecytoskeletsignalering.

conclusie In ons onderzoek vonden wij (1) verminderde expressie van 29 genen in de 22q11-regio en (2) verschillende ontregelde signaalpaden waarvan met name neurotropine/trk- en neuregulinesignalering van belang lijken voor schizofrenie. Wij concluderen dat de moleculair-biologische achtergrond van de psychotische verschijnselen bij vcfs (deels) dezelfde achtergrond hebben als bij schizofrenie.